横琴二桥采用钢桁拱桥结构形式，南北引桥均采用整幅大挑臂展翅箱梁结构。拱肋上、下弦均采用箱形变截面；拱肋采用整体式节点，杆件采用栓焊组合结构形式；桥面系采用密纵梁体系叠合混凝土桥面板结构形式。横琴二桥通过剪力钉及湿接缝与横梁及次纵梁连接。系杆采用刚性系杆和柔性系杆共同受力的混合体系，中跨刚性系杆采用H形截面，柔性系杆采用单根张拉钢绞线系杆体系。吊杆采用双吊杆体系，吊索及锚具采用标准强度为1 670 MPa的镀锌平行钢丝成品吊杆系列。主结构钢材为Q420qD、Q345qD，临时结构钢材为Q345B。